MUDr. Jiří Votruba, Ph.D. se aktivně podílí na výzkumu nových metod moderní medicíny. Je hlavním zkoušejícím rozličných klinických studií nejen na poli pneumologie a onkologie. Klinické studie přináší pacientům zpravidla nové možnosti léčby závažných onemocnění. Mimo to aktivně vyvíjí nové bronchoskopické metody, či do České republiky přiváží metody používané doposud pouze v zahraničí. Podílel se také na vzniku některých knižních publikací.